Обычно проблема исчезновения ползунка происходит при конфликте jQuery с другой библиотекой. Такая проблема обнаружилась на joomla сайте и была связана с тем, что в joomla используется mootools (например подключая "Обработчик модальных окон Joomla JHTML::_('behavior.modal')", подключаются библиотеки mootools-core.js,core.js,mootools-more.js,modal.js или используя плагин RokBox от rockettheme, он так же использует эти библиотеки js), у которого тоже есть функция Slider(). Вот и получается, что происходит конфликт одноименных функций. Решение:
Перед инициализацией слайдера просто нужно добавить код:
jQuery("#slider").prop("slide",null);
Где #slider — id вашего слайда